El juego no empieza en Pueblo Paleta de la forma tradicional. La narrativa se adapta para sentir que estás jugando un episodio de la serie. Los eventos están ordenados cronológicamente según el anime. Visitas lugares como el Valle Solar, el Centro de Crianza Pokémon, y te encuentras con personajes icónicos como Ritchie, Casey y, por supuesto, el malhumorado Gary Oak.